Se encuentra dentro del casco urbano de la ciudad de Loja, muy cerca de la Iglesia Mayor de Santa María de la Encarnación, de donde toma el nombre. Se accede desde la Placeta de la Encarnación, situada junto a la iglesia, por la calle Agua. El manantial se encuentra en dicha calle, a unos 35 m de la placeta, justo al inicio del tramo escalonado, oculto por una pequeña puerta metálica, en los mismos cimientos de una casa. La llave de la puerta solo está disponible en el Ayuntamiento y, eventualmente, en la casa anexa.