Los Arcos del Cobre forman parte del conocido como Acueducto de Algeciras y fue construido en una segunda fase entre 1841 y 1845. Su misión era la de conducir el agua procedente del Nacimiento de las Minillas en El Cobre ya que la del Río de la Miel y la de los pozos no era suficiente. Inicialmente este agua transcurría por el Cobre desde el manantial por tuberías subterráneas hasta llegar al Acueducto de la Bajadilla construido un siglo antes, entre 1777 y 1783.
Al poco tiempo de la inauguración de Acueducto de la Bajadilla en 1783 los propios arquitectos de la obra pusieron de manifiesto la necesidad de levantar un segundo tramo que salvara el desnivel del terreno a la altura de El Cobre. Este desnivel hacía que la presión del agua reventara habitualmente las conducciones subterráneas, que debían ser reparadas continuamente. A pesar de esta recomendación las obras del segundo tramo, conocido actualmente como Arcos de El Cobre, no comenzaron hasta 1841 terminando en 1845.
Los arcos de El Cobre eran de menor altura que los construidos el siglo anterior y llevaron adosados contrafuertes desde el momento de su construcción.